Plateau d’analyses morphofonctionnelles
Responsable : Pierre HENER
Principe
Le plateau d’analyses morpho-fonctionnelles a pour but de permettre d’accompagner les chercheurs de l’unité dans la mise en œuvre les dernières méthodes d’études des tissus biologiques. En collaboration avec l’UAR3156, la plateforme d’imagerie du Neuropôle, nous assistons les chercheurs pour l’acquisition des images. Pour l’analyse des images, nous proposons des formations aux logiciels d’analyse d’image (Fiji/ImageJ, Qupath, Ilastik…) et le développement d’analyses automatisées (classification, segmentation).
Applications :
- Transparisation de tissus
- Microscopie d’expansion
- Hybridation in situ (système RNAscope)
- Immunomarquages (immunofluorescence, immunohistochimie)
Les prestations
- Conseils pour la mise au point des protocoles
- Formation aux différentes techniques
- Aide à la préparation des échantillons et à l’obtention de coupes histologiques
- Accompagnement pour l’acquisition et à l’analyse des images
- Prêt et mise en commun de matériel (four à hybridation, solutions de transparisation…)
Principaux Equipements
Appareils de coupes disponibles au sein de l’Institut
(Responsable : Stéphanie DUMONT-KIENTZY : dumonts@unistra.fr)
(Responsable : Stéphanie DUMONT-KIENTZY : dumonts@unistra.fr)
- Cryostats CM3050S
- Vibratome VT1000S et VT1000E
- Microtome RM2245
Les acquisitions d’images sont effectuées au niveau :
- du plateau Microscopie et Macroscopie (Responsable : Anne-Marie HAEBERLE, IE CNRS)
- de la Plateforme Imagerie in Vitro (Responsable : Sylvette CHASSEROT-GOLAZ, CR1 Inserm)
Seul le personnel de laboratoire ayant reçu les instructions nécessaires lors d’une formation est autorisé à utiliser le matériel proposé par le plateau d’analyses morpho-fonctionnelles.
Membres & Contacts
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Pierre HENER (IE CNRS) |
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Stéphanie DUMONT-KIENTZY (AI Unistra) |
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Aline HUBER (AI CNRS) |
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Catherine MOREAU (IE Unistra) |
Les réservations des stations/PC d’analyse
Les stations/PC d’analyse sont situés au 1ier étage dans la salle 1010.